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这一时期日本因素在台湾人族群认同上的作用有波动，为清晰起见，笔者分三个时期展开论述。
（1） 日本与50、60年代的台独──促进
上文说过，日本在台湾的五十年统治培育了大批具有「皇民意识」的台湾知识份子。日台经济文化密切交流、人员大量往来，四十年代台湾人旅居海外的人数以日本最多，达两万多人，所以早期海外台独活动的中心在日本，其中以廖文毅、廖文奎、吴振南、史明等最为活跃。廖氏兄弟为台湾云林人，廖文毅先毕业于日本同志社大学中学部，后于美国俄亥俄州立大学获得工学博士学位。廖文毅1945年在台湾创立「台湾民族精神振兴会」，1947年办「自治法研究会」，鼓吹成立「中国联邦」，台湾在联邦体制内完全自治。1947年6月廖氏兄弟在上海以「台湾再解放联盟」的名义在美国人办的《密勒氏评论报》上发文揭露国民党屠杀台湾人的罪行，次月向美国特使魏德迈递交《处理台湾意见书》，这是台独运动史上第一份纲领性文件，其中要求美国政府帮助台湾达到：在台湾实施大西洋宪章，台湾人派代表出席日本和会讨论台湾归属问题，准许台湾公民投票决定台湾未来，在此之前台湾脱离中国，暂时置于联合国托管理事会下，等等。1949年廖文毅在日本与吴振南、郭泰成等成立「台湾民主独立党」，办《台湾民报》（不是前面的《台湾民报》），发表《告台湾八百万同胞宣言》，宣传「台湾民族论」，宣称「台湾人不是汉族，而是高山族、西班牙人、荷兰人、日本人、汉人的混血种」。廖文毅1955年在东京成立「台湾共和国临时议会」，1956年2月28日伙同30多人成立「台湾共和国临时政府」并自任「大总统」。另外，1960年2月王育德与黄昭堂成立「台湾青年社」，4月发行《台湾青年》鼓吹台湾独立。辜宽敏1963年加入后该组织改名为「台湾青年独立联盟」，以昭和为年号，以红太阳为国旗，周旋于日本权贵之间，被视为「以皇民化路线搞台独」。1967年史明成立「独立台湾会」，宣称该会是「以科学社会主义为思想武装的党，以劳动大众的立场为自己的立场，以担负完成历史所交付的使命」。这些显然是在有意识地建构台湾本省人的族群认同意识140。
（2） 20世纪70、80年代──断交、废约后保持民间关系但经贸联系密切
日本仍然是台湾除美国外最重要的贸易伙伴，1972年，台对日贸易占出口的12％和进口的42％。1972～1979，台湾从日本的进口总值增长4倍，而对日本的出口增长6倍141。事实上，日本对中国大陆的出口额2001年起才超过对台湾出口额142。
（3） 李─陈时期──在暧昧中支援，出谋划策，来往密切
中国国际问题研究所晋林波谈到：「日本现在的政界、学界都对台湾的影响非常大，台湾当局某些政策的出台，都发源于日本学界。比如民进党过去建立的「台湾建国联盟」等台独机构都设在日本，一些在日的台湾学者已经成为陈水扁当局的『国策顾问』。 再比如，台独势力号称要在二○○八年北京奥运会前宣布独立，这很大程度上也是日本学者的主意。从这个意义上讲，日本对台湾的影响比美国还要具体」143。
不难判定，日本因素在台湾问题上的作用就国别而言，仅次于美国，且有加大的趋势。日本一些重要政党的议员频频访台144，1997年还成立了200多人的「日台关系议员恳谈会」,囊括近半数日本国会议员。又如2004年5月18日日本投票赞成台湾以观察员身份加入世界卫生组织即是个信号（投赞成票的，除了日本外，就是美国和台湾的「邦交国」）145。
4.2.2 美国因素与台湾人族群认同
美国因素的作用可以分为两个部分：一方面是台湾对美国的争取与利用，另一方面是美国对台军事支援，但美国对台政策法律也经历了变化。上述两方面都在台湾人的族群认同上表现出来，下面分别予以说明。
1. 台湾对美国的争取和利用
六十年代中期以后海外台独的重心转到美国，其基础是台湾留美学生、学者与移居美国的台湾中产阶级。与日本的皇民化台独不同，他们反思台独活动的基本思想和做法，认为不能以向美国请愿的方式活动，需建立自己的实力，提出独立运动是群众运动，要独立必须不惜流血，酝酿成立全球性「台湾独立联盟」。因早期「暴力革命」路线在实践时被美国视作暴力恐怖组织后，台独分子调整策略，彭明敏等人主张的「以务实、民主、合法的途径追求台独」路线为大多数海外台独分子接受。他们通过游说美国国会、动员教会力量等在美国形成了一个相当强大的台独支援势力，这在中坜事件、美丽岛事件得到明显的表现146。他们后来还与别的势力联合推动了《与台湾关系法》的通过。针对蒋家父子的专制统治，他们根据美国的情况，将台独目标包装成对人权、民主、自由的追求，在台湾前途问题上采取「创造性暧昧」的策略，提出「住民自决」的主张。陈少廷等人搞的「住民自决论」挑动省籍矛盾，强化本省人的族群认同，排斥外省人。由于不少法学家参与创建这一理论，它成了台独的主要理论依据之一。这些策略，确实在一定程度上「争取到了美国国会、国务院的友谊，唤起了他们对台湾人权运动的支援」147。台独分子的这些活动，大大促进了台湾人族群认同的形成。
